Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAD23BP54727 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAD23BP54727 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms