Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLNS1AP54105 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLNS1AP54105 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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