Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDST1P52848 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDST1P52848 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDST1P52848 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NDST1P52848 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDST1P52848 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDST1P52848 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDST1P52848 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDST1P52848 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDST1P52848 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NDST1P52848 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDST1P52848 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDST1P52848 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NDST1P52848 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDST1P52848 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDST1P52848 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDST1P52848 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDST1P52848 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDST1P52848 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDST1P52848 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDST1P52848 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDST1P52848 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDST1P52848 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDST1P52848 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NDST1P52848 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDST1P52848 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDST1P52848 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDST1P52848 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDST1P52848 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NDST1P52848 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NDST1P52848 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDST1P52848 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDST1P52848 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDST1P52848 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NDST1P52848 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NDST1P52848 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDST1P52848 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDST1P52848 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDST1P52848 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDST1P52848 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDST1P52848 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NDST1P52848 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST1P52848 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST1P52848 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST1P52848 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST1P52848 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST1P52848 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST1P52848 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST1P52848 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST1P52848 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST1P52848 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST1P52848 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST1P52848 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NDST1P52848 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST1P52848 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST1P52848 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST1P52848 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST1P52848 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST1P52848 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST1P52848 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST1P52848 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST1P52848 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST1P52848 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST1P52848 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST1P52848 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NDST1P52848 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST1P52848 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST1P52848 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST1P52848 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST1P52848 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST1P52848 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST1P52848 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST1P52848 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST1P52848 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST1P52848 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST1P52848 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NDST1P52848 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST1P52848 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST1P52848 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST1P52848 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST1P52848 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST1P52848 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST1P52848 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST1P52848 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST1P52848 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST1P52848 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST1P52848 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST1P52848 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST1P52848 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NDST1P52848 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST1P52848 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST1P52848 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST1P52848 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST1P52848 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST1P52848 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST1P52848 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST1P52848 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST1P52848 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST1P52848 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NDST1P52848 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms