Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC3P51654 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC3P51654 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC3P51654 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC3P51654 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC3P51654 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC3P51654 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC3P51654 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GPC3P51654 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC3P51654 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC3P51654 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC3P51654 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC3P51654 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC3P51654 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC3P51654 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC3P51654 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC3P51654 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GPC3P51654 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC3P51654 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC3P51654 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC3P51654 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC3P51654 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC3P51654 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC3P51654 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC3P51654 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC3P51654 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GPC3P51654 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC3P51654 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC3P51654 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC3P51654 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC3P51654 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC3P51654 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC3P51654 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC3P51654 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC3P51654 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC3P51654 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC3P51654 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC3P51654 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC3P51654 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC3P51654 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GPC3P51654 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC3P51654 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC3P51654 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC3P51654 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC3P51654 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC3P51654 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC3P51654 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC3P51654 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC3P51654 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC3P51654 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC3P51654 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC3P51654 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC3P51654 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC3P51654 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC3P51654 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GPC3P51654 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC3P51654 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC3P51654 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC3P51654 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC3P51654 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC3P51654 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC3P51654 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC3P51654 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC3P51654 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC3P51654 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC3P51654 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GPC3P51654 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPC3P51654 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPC3P51654 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GPC3P51654 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC3P51654 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC3P51654 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC3P51654 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC3P51654 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC3P51654 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC3P51654 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC3P51654 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC3P51654 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC3P51654 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC3P51654 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC3P51654 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC3P51654 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC3P51654 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC3P51654 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC3P51654 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC3P51654 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC3P51654 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC3P51654 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC3P51654 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC3P51654 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC3P51654 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC3P51654 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC3P51654 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC3P51654 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC3P51654 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC3P51654 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC3P51654 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC3P51654 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC3P51654 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC3P51654 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms