Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIK3CBP42338 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PIK3CBP42338 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 265.8 ms