Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PIK3CAP42336 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PIK3CAP42336 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms