Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEACAM3P40198 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CEACAM3P40198 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEACAM3P40198 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEACAM3P40198 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEACAM3P40198 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEACAM3P40198 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms