Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP12P39900 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP12P39900 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP12P39900 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP12P39900 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP12P39900 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP12P39900 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP12P39900 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP12P39900 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP12P39900 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP12P39900 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP12P39900 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP12P39900 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP12P39900 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP12P39900 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP12P39900 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP12P39900 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP12P39900 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP12P39900 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP12P39900 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP12P39900 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP12P39900 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP12P39900 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP12P39900 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP12P39900 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP12P39900 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP12P39900 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP12P39900 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP12P39900 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP12P39900 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP12P39900 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP12P39900 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP12P39900 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP12P39900 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP12P39900 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP12P39900 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP12P39900 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP12P39900 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP12P39900 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP12P39900 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP12P39900 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP12P39900 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP12P39900 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP12P39900 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP12P39900 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP12P39900 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP12P39900 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP12P39900 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP12P39900 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP12P39900 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP12P39900 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP12P39900 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP12P39900 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP12P39900 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP12P39900 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP12P39900 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP12P39900 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP12P39900 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP12P39900 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP12P39900 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP12P39900 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP12P39900 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP12P39900 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP12P39900 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP12P39900 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP12P39900 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP12P39900 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP12P39900 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP12P39900 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP12P39900 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP12P39900 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP12P39900 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP12P39900 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP12P39900 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP12P39900 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP12P39900 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP12P39900 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP12P39900 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP12P39900 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP12P39900 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP12P39900 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP12P39900 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP12P39900 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP12P39900 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP12P39900 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP12P39900 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP12P39900 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP12P39900 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP12P39900 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP12P39900 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP12P39900 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP12P39900 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP12P39900 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP12P39900 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP12P39900 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP12P39900 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP12P39900 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP12P39900 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP12P39900 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP12P39900 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms