Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
ZEB1P37275 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZEB1P37275 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZEB1P37275 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms