Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRS3P32247 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BRS3P32247 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BRS3P32247 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRS3P32247 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRS3P32247 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRS3P32247 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BRS3P32247 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BRS3P32247 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BRS3P32247 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRS3P32247 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRS3P32247 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRS3P32247 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRS3P32247 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRS3P32247 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRS3P32247 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRS3P32247 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRS3P32247 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BRS3P32247 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BRS3P32247 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRS3P32247 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BRS3P32247 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRS3P32247 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRS3P32247 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRS3P32247 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRS3P32247 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRS3P32247 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRS3P32247 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRS3P32247 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRS3P32247 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRS3P32247 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRS3P32247 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRS3P32247 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BRS3P32247 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRS3P32247 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BRS3P32247 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRS3P32247 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRS3P32247 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BRS3P32247 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRS3P32247 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRS3P32247 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRS3P32247 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRS3P32247 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BRS3P32247 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BRS3P32247 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRS3P32247 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRS3P32247 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRS3P32247 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRS3P32247 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BRS3P32247 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRS3P32247 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BRS3P32247 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRS3P32247 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRS3P32247 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRS3P32247 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRS3P32247 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRS3P32247 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRS3P32247 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRS3P32247 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRS3P32247 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRS3P32247 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRS3P32247 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
BRS3P32247 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRS3P32247 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRS3P32247 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRS3P32247 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRS3P32247 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BRS3P32247 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BRS3P32247 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms