Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HTR2AP28223 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HTR2AP28223 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms