Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA2P24043 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA2P24043 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms