Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRM1P23921 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRM1P23921 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRM1P23921 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRM1P23921 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRM1P23921 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRM1P23921 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRM1P23921 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRM1P23921 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRM1P23921 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RRM1P23921 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRM1P23921 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRM1P23921 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRM1P23921 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRM1P23921 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRM1P23921 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRM1P23921 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRM1P23921 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRM1P23921 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRM1P23921 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRM1P23921 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRM1P23921 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRM1P23921 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRM1P23921 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRM1P23921 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRM1P23921 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RRM1P23921 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRM1P23921 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRM1P23921 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRM1P23921 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RRM1P23921 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRM1P23921 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRM1P23921 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRM1P23921 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRM1P23921 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRM1P23921 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RRM1P23921 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRM1P23921 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RRM1P23921 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRM1P23921 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRM1P23921 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRM1P23921 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRM1P23921 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRM1P23921 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRM1P23921 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRM1P23921 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RRM1P23921 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RRM1P23921 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRM1P23921 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRM1P23921 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRM1P23921 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RRM1P23921 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRM1P23921 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRM1P23921 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRM1P23921 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRM1P23921 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRM1P23921 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRM1P23921 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRM1P23921 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RRM1P23921 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRM1P23921 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRM1P23921 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRM1P23921 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRM1P23921 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRM1P23921 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRM1P23921 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRM1P23921 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RRM1P23921 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRM1P23921 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRM1P23921 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRM1P23921 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRM1P23921 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRM1P23921 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRM1P23921 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRM1P23921 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RRM1P23921 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRM1P23921 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRM1P23921 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRM1P23921 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRM1P23921 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RRM1P23921 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRM1P23921 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRM1P23921 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRM1P23921 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRM1P23921 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRM1P23921 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRM1P23921 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRM1P23921 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RRM1P23921 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRM1P23921 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRM1P23921 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRM1P23921 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRM1P23921 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRM1P23921 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRM1P23921 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRM1P23921 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RRM1P23921 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRM1P23921 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRM1P23921 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRM1P23921 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms