Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP2B1P20020 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP2B1P20020 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP2B1P20020 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms