Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFHP12036 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEFHP12036 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFHP12036 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFHP12036 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFHP12036 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFHP12036 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFHP12036 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFHP12036 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFHP12036 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFHP12036 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEFHP12036 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEFHP12036 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEFHP12036 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEFHP12036 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEFHP12036 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEFHP12036 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEFHP12036 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFHP12036 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFHP12036 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFHP12036 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFHP12036 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFHP12036 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFHP12036 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFHP12036 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFHP12036 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFHP12036 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFHP12036 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFHP12036 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEFHP12036 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFHP12036 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFHP12036 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFHP12036 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFHP12036 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFHP12036 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFHP12036 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFHP12036 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEFHP12036 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFHP12036 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFHP12036 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFHP12036 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFHP12036 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFHP12036 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFHP12036 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFHP12036 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEFHP12036 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFHP12036 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFHP12036 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFHP12036 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFHP12036 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFHP12036 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFHP12036 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFHP12036 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFHP12036 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFHP12036 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFHP12036 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFHP12036 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFHP12036 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEFHP12036 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFHP12036 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFHP12036 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFHP12036 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFHP12036 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFHP12036 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFHP12036 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFHP12036 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFHP12036 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFHP12036 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFHP12036 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFHP12036 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFHP12036 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFHP12036 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEFHP12036 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFHP12036 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFHP12036 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFHP12036 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFHP12036 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFHP12036 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFHP12036 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFHP12036 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFHP12036 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFHP12036 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFHP12036 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEFHP12036 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NEFHP12036 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NEFHP12036 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NEFHP12036 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFHP12036 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFHP12036 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFHP12036 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFHP12036 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFHP12036 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFHP12036 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFHP12036 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFHP12036 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFHP12036 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEFHP12036 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFHP12036 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFHP12036 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEFHP12036 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms