Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CALM1P0DP23 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CALM1P0DP23 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALM1P0DP23 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALM1P0DP23 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CALM1P0DP23 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms