Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLDN7O95471 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN7O95471 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms