Protein–RNA interactions for Protein: O94979

SEC31A, Protein transport protein Sec31A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31AO94979 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC31AO94979 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEC31AO94979 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEC31AO94979 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms