Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSDE1O75534 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSDE1O75534 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSDE1O75534 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms