Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLDN11O75508 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLDN11O75508 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms