Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIA4O75335 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIA4O75335 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms