Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PHACTR2O75167 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHACTR2O75167 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms