Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRAK2O60296 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRAK2O60296 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms