Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHADO15335 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHADO15335 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHADO15335 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHADO15335 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHADO15335 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHADO15335 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHADO15335 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHADO15335 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHADO15335 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHADO15335 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHADO15335 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHADO15335 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHADO15335 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHADO15335 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHADO15335 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHADO15335 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHADO15335 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHADO15335 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHADO15335 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHADO15335 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CHADO15335 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHADO15335 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHADO15335 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHADO15335 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHADO15335 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHADO15335 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHADO15335 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHADO15335 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHADO15335 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CHADO15335 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHADO15335 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHADO15335 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHADO15335 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHADO15335 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHADO15335 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHADO15335 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHADO15335 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHADO15335 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHADO15335 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHADO15335 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHADO15335 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHADO15335 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHADO15335 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHADO15335 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHADO15335 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHADO15335 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHADO15335 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHADO15335 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHADO15335 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHADO15335 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHADO15335 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHADO15335 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHADO15335 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHADO15335 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHADO15335 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHADO15335 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHADO15335 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHADO15335 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHADO15335 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHADO15335 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHADO15335 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHADO15335 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHADO15335 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHADO15335 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHADO15335 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHADO15335 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHADO15335 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHADO15335 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHADO15335 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHADO15335 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHADO15335 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHADO15335 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHADO15335 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHADO15335 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHADO15335 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHADO15335 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHADO15335 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHADO15335 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHADO15335 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHADO15335 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHADO15335 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHADO15335 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHADO15335 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHADO15335 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHADO15335 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHADO15335 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHADO15335 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHADO15335 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHADO15335 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHADO15335 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHADO15335 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHADO15335 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CHADO15335 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHADO15335 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHADO15335 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHADO15335 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHADO15335 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHADO15335 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHADO15335 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms