Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
U2SURPO15042 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
U2SURPO15042 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
U2SURPO15042 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
U2SURPO15042 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
U2SURPO15042 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
U2SURPO15042 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
U2SURPO15042 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
U2SURPO15042 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
U2SURPO15042 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
U2SURPO15042 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
U2SURPO15042 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130 ms