Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM200CA6NKL6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM200CA6NKL6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM200CA6NKL6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM200CA6NKL6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM200CA6NKL6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM200CA6NKL6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM200CA6NKL6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM200CA6NKL6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM200CA6NKL6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms