Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCE3A1L190 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCE3A1L190 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms