Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBA6A0AVT1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBA6A0AVT1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms