Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 CASC4P1-201ENST00000456608 1312 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 FAM9A-201ENST00000381003 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 RHBDL2-201ENST00000289248 2129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 RPS21-202ENST00000370562 1002 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC064836.1-201ENST00000405197 704 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 ALDH7A1-203ENST00000413020 1126 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 VDAC1P13-201ENST00000447826 859 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 GINS4-203ENST00000518671 1158 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 PMM2-216ENST00000569958 698 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 RN7SL750P-201ENST00000582814 238 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC011472.2-201ENST00000586356 655 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 LINC01988-202ENST00000636975 921 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 ARRB2-207ENST00000571206 1659 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 ACAD11-204ENST00000481970 1891 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 GPM6B-203ENST00000356942 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 SMN1-202ENST00000380707 1536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 SMN2-203ENST00000380743 1536 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 LINC01115-202ENST00000621134 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 CNMD-201ENST00000377962 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 MSRA-202ENST00000382490 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 ZNF816-201ENST00000270457 582 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 CHMP2A-201ENST00000312547 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 THYN1-202ENST00000352327 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 DMKN-203ENST00000402589 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC234771.1-201ENST00000416873 250 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 MAS1LP1-206ENST00000419416 1047 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 C2orf27AP2-201ENST00000438438 555 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 UCMA-202ENST00000463405 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 OR7E14P-201ENST00000526721 1000 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC010547.1-202ENST00000567341 230 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 CHMP2A-206ENST00000600118 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC245369.3-201ENST00000624687 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 STPG4-201ENST00000294947 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 LMX1A-203ENST00000367893 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 PAX6-217ENST00000481563 1587 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 C16orf78-201ENST00000299191 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 WFDC2-202ENST00000339946 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 WFDC2-204ENST00000372676 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 OR2A15P-201ENST00000463814 900 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 LRRC75A-AS1-208ENST00000480811 968 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 IGHV3-6-201ENST00000518407 347 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 HDAC2-AS2-216ENST00000522844 808 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 KRT18P7-201ENST00000557241 1219 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC051619.6-201ENST00000558039 595 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 ELP5-210ENST00000573657 687 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIRT1Q96EB6 AC021594.2-201ENST00000592499 527 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms