Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 MEOX1-203ENST00000393661 1206 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 HLA-DQA1-203ENST00000395363 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 B9D1-204ENST00000395616 733 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 MT1XP1-201ENST00000421314 186 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 LINC00158-203ENST00000440205 740 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ST3GAL6-207ENST00000468553 715 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 SLED1-201ENST00000506741 751 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 FAM83A-AS1-201ENST00000517519 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 LINC01828-205ENST00000594329 863 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 LINC02348-201ENST00000618724 489 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 PAX6-217ENST00000481563 1587 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 HRH2-201ENST00000231683 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 IL36A-201ENST00000259211 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 GALM-202ENST00000410063 1023 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC099796.2-201ENST00000444140 108 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC008937.1-201ENST00000453721 914 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AP005901.1-201ENST00000508721 1181 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AL627230.7-201ENST00000613971 601 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC004494.2-201ENST00000623168 830 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 FP671120.4-201ENST00000629969 923 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AL138762.1-201ENST00000608554 1637 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 TNFAIP3-211ENST00000621150 1613 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 KRT40-202ENST00000398486 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 FAM173B-207ENST00000511437 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 CDK5-201ENST00000297518 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 OR4C5-201ENST00000319813 981 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AL449266.1-201ENST00000357393 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 APOBEC3F-202ENST00000381565 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AL354707.2-201ENST00000412339 422 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 HTR3D-203ENST00000428798 1215 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 LSP1P3-201ENST00000449530 208 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 RPL18AP2-201ENST00000450007 482 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 HTR3D-204ENST00000453435 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC005534.1-201ENST00000455709 742 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 IGKV2D-24-201ENST00000462693 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 IGKV2-24-201ENST00000484817 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 IGLCOR22-1-201ENST00000523725 316 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AP000763.1-201ENST00000539481 325 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ZNF761-204ENST00000610928 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC003101.3-201ENST00000624452 768 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 C16orf46-202ENST00000378611 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 CHMP2A-201ENST00000312547 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 AL031770.1-201ENST00000430842 851 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRMP28827 KRTAP4-16-201ENST00000440582 708 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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