Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 MRO-203ENST00000428869 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 BIVM-201ENST00000257336 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 LOXHD1-204ENST00000398705 1824 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 FAM84A-202ENST00000331243 3765 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 CDK5RAP1-201ENST00000339269 1891 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 KCND3-203ENST00000369697 7396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AL109976.1-201ENST00000621919 5678 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 OLFML2B-201ENST00000294794 3160 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP25-201ENST00000409030 2936 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 REPS1-205ENST00000415951 2424 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 TRPC7-203ENST00000502753 2424 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC120114.4-201ENST00000623731 2194 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 HERC2P3-208ENST00000430598 4279 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 FUT8-204ENST00000394586 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ADGRF3-202ENST00000333478 3896 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ITGA4-203ENST00000397033 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 BANK1-201ENST00000322953 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 MPPE1-202ENST00000317235 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 UBE2G1-201ENST00000396981 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SRC-203ENST00000373567 4321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 POLR3H-203ENST00000396504 4176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 LAMB3-202ENST00000367030 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 VDR-208ENST00000550325 3925 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SCN8A-215ENST00000638820 3359 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 RUBCNL-208ENST00000429979 3979 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 YPEL2-201ENST00000312655 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 CELF4-203ENST00000420428 4052 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 HMGB1-202ENST00000339872 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 DNMBP-201ENST00000324109 6400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 LINC02202-201ENST00000499583 2664 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 POLR2J4-202ENST00000427076 6466 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 TADA2B-205ENST00000515646 3818 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 CCDC129-201ENST00000319386 4544 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ADGRD1-202ENST00000335486 2892 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 SHC1-203ENST00000368449 2879 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 EFHD1-204ENST00000410095 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 C12orf74-201ENST00000397833 1856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 C19orf47-208ENST00000582783 3628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 QRICH2-201ENST00000262765 5357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 ALOX5-208ENST00000612635 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 HERC6-203ENST00000380265 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SMIM3Q9BZL3 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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