Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AL390726.1-201ENST00000451357 202 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AC103925.1-201ENST00000453155 771 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AL356479.1-202ENST00000456933 714 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 RPLP0P2-204ENST00000490750 961 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 LINC02163-201ENST00000514769 574 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 OR10V2P-201ENST00000525296 764 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CDK2AP1-204ENST00000538446 1161 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AP000439.1-201ENST00000544004 581 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AL162464.2-201ENST00000557761 526 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AC022392.1-201ENST00000609403 744 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AC108002.3-201ENST00000612629 503 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 SPDL1-216ENST00000629457 340 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AC012442.3-201ENST00000636053 940 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AC109635.4-201ENST00000636653 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CEP70-208ENST00000474781 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 GPHN-202ENST00000459628 1723 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 SNU13-201ENST00000215956 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 SMN1-202ENST00000380707 1536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 SMN2-203ENST00000380743 1536 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 GOSR2-231ENST00000640007 1425 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 GHRL-201ENST00000287656 1313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 FBXO39-201ENST00000321535 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 ACAA2-205ENST00000587994 1657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 SLC26A5-211ENST00000432958 2588 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 PMP22-203ENST00000395938 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 MAL-202ENST00000349807 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 VSTM1-202ENST00000366170 654 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 MORN2-205ENST00000410014 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 EEF1DP8-201ENST00000534760 536 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 NKAPP1-203ENST00000554109 573 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AC003688.2-201ENST00000576271 415 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 SRGAP3-AS2-203ENST00000600323 1294 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 TNFSF13-209ENST00000625791 955 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AL138762.1-201ENST00000608554 1637 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 C16orf46-202ENST00000378611 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CACNA1G-AS1-202ENST00000505793 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AC106799.1-201ENST00000503188 1676 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 DNPEP-220ENST00000523282 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AC034238.1-214ENST00000609699 1590 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 TAF11-202ENST00000420584 1465 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 ACRBP-202ENST00000414226 1700 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 AC240565.1-201ENST00000624936 1373 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 MEG8-220ENST00000636052 1369 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 CCDC70-201ENST00000242819 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 TMIGD1-201ENST00000328886 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 SERF2-210ENST00000409960 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTF1AQ7RTS3 ALDH7A1-203ENST00000413020 1126 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms