Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CPVL-201ENST00000265394 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC073476.3-201ENST00000563949 2507 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 VPS45-211ENST00000535106 2695 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 INS-IGF2-205ENST00000641326 2861 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 DIRAS1-201ENST00000323469 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ETFDH-201ENST00000307738 1903 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ELOA2-201ENST00000332567 3050 ntAPPRIS P2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 NDUFAF7-202ENST00000336237 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 SEZ6L2-203ENST00000350527 3173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 DDX4-201ENST00000353507 2778 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 G3BP1-201ENST00000356245 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CR2-202ENST00000367058 4063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AGPAT1-206ENST00000395499 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 GRAMD1B-203ENST00000456860 2805 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 MRVI1-214ENST00000534266 2824 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 FAIM2-205ENST00000550890 2094 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 GLDN-210ENST00000612989 1676 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 HSPA4-204ENST00000615899 2204 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 LRRCC1-201ENST00000360375 3813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 GIMAP6-201ENST00000328902 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TMEM198B-202ENST00000478241 2924 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 GTPBP2-201ENST00000307114 2830 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TP63-209ENST00000437221 2500 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 SPRTN-204ENST00000391858 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TLR5-201ENST00000366881 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 STX16-202ENST00000355957 4897 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 LCTL-201ENST00000341509 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 HOPX-205ENST00000420433 1543 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CAMTA2-201ENST00000348066 4491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 GPATCH2L-212ENST00000557263 1458 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CYB5R3-202ENST00000361740 2938 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CCDC144CP-201ENST00000340196 2823 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ARHGAP40-202ENST00000373345 2841 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 NCAM1-230ENST00000621850 2787 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ENOX2-203ENST00000370935 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AQP7-207ENST00000447660 998 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
LSAMPQ13449 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms