Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 ZCWPW1-208ENST00000490721 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 CYP1A2-201ENST00000343932 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 DYNC1I1-205ENST00000447467 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 FBF1-210ENST00000592193 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 GPR173-201ENST00000332582 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 SLC17A9-202ENST00000370351 3580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 TRIM68-201ENST00000300747 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 OTUD6B-201ENST00000285420 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 TRAF3IP3-203ENST00000367025 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 AC120024.4-201ENST00000624285 2143 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 HSH2D-206ENST00000613986 1957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 IQCB1-202ENST00000349820 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 AC009133.3-201ENST00000565600 1656 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 SOCS2-AS1-201ENST00000499137 3325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 FAM47DP-201ENST00000402340 3290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 HERC2P3-208ENST00000430598 4279 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 CUL4A-204ENST00000451881 3724 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 OACYLP-201ENST00000417918 2208 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 DDX56-204ENST00000431640 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 COL22A1-203ENST00000435777 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 NTRK3-204ENST00000360948 3004 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 EHD1-201ENST00000320631 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 AC010997.4-201ENST00000609200 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 CDKN2B-201ENST00000276925 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 ELP4-212ENST00000638764 2456 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 PLAGL1-209ENST00000444202 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SKOR2Q2VWA4 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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