Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 SCHIP1-201ENST00000445224 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 FAM156A-203ENST00000611661 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 RHBDL2-201ENST00000289248 2129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 GSTM1-204ENST00000369823 852 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 CRYBB2-201ENST00000398215 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 BCRP5-201ENST00000514371 253 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 AC092435.2-201ENST00000515530 524 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 AC126471.1-201ENST00000550676 362 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 AC007608.2-201ENST00000569940 1146 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 TACC1-209ENST00000520611 1550 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 CDCA7L-202ENST00000373934 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 C3orf36-201ENST00000408895 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 ATAT1-204ENST00000330083 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FHOD3Q2V2M9 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 PKMP1-201ENST00000455804 1523 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 TRIM15-206ENST00000376688 426 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 RPL19P20-201ENST00000415648 591 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 PSMD6-209ENST00000482510 1176 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 GABARAPL2-203ENST00000565057 571 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 AC106774.4-201ENST00000600799 409 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 KRT40-201ENST00000377755 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 AL138762.1-201ENST00000608554 1637 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 NDEL1-203ENST00000402554 1858 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 LCE2D-201ENST00000368784 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 AL929472.4-201ENST00000447422 691 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 MIR22HG-206ENST00000573127 899 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 KRT16P4-202ENST00000580052 362 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 U62317.4-201ENST00000609758 448 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 GMPS-201ENST00000295920 2024 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 CYP20A1-210ENST00000613925 1986 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 SGCE-201ENST00000265735 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 UGT1A6-202ENST00000373424 1128 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 AC004884.1-201ENST00000393647 319 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FHOD3Q2V2M9 AL365194.1-201ENST00000440032 361 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms