Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 USP33-204ENST00000370794 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 AGAP6-202ENST00000412531 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 MXRA5Y-201ENST00000420610 8000 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 ZNF133-201ENST00000316358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 NTNG1-207ENST00000370073 3347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 PIK3R5-202ENST00000447110 4495 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 TAF5L-204ENST00000366676 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 PRAME-203ENST00000402697 2057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 HLCS-202ENST00000399120 6466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 MIEF1-201ENST00000325301 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 KLK2-202ENST00000358049 2847 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 AC024560.1-201ENST00000424493 1471 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 TEF-202ENST00000406644 4386 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 FAM90A17P-201ENST00000533716 1957 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 ZKSCAN5-202ENST00000394170 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 ASPH-208ENST00000517856 6337 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 BARD1-212ENST00000617164 5449 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 PCDHA9-201ENST00000378122 6900 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 PTK7-204ENST00000349241 3801 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 ABCB9-211ENST00000540285 3330 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
HERVK_113P63121 CADM3-202ENST00000368125 3745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms