Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 SAP30L-AS1-202ENST00000519727 396 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AP001107.8-201ENST00000530805 479 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC124947.1-201ENST00000552835 814 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 RN7SL624P-201ENST00000580297 278 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC090844.3-201ENST00000583462 784 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 LIN28B-AS1-204ENST00000636951 610 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 FAM156A-203ENST00000611661 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 CD27-AS1-209ENST00000545339 1766 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 CNTF-201ENST00000361987 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 FAM114A2-211ENST00000520667 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 MDM1-204ENST00000411698 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 PRKAG1-201ENST00000316299 1683 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 IFITM2-202ENST00000399817 659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AL121761.1-203ENST00000426012 677 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 MTND6P14-201ENST00000433044 522 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 C8orf86-202ENST00000437935 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ZFR2-203ENST00000439086 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AL354733.3-201ENST00000448389 390 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 RGPD4-AS1-202ENST00000457647 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AL390061.1-201ENST00000457804 293 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 RN7SL255P-201ENST00000470639 296 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 PTDSS1-206ENST00000522072 1112 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 TRAPPC4-209ENST00000528230 583 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AP000911.1-204ENST00000533091 571 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC112236.2-201ENST00000608402 845 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 NOP16-210ENST00000619979 963 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AGFG1-203ENST00000409171 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AL590552.1-201ENST00000623164 1770 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 MEOX1-203ENST00000393661 1206 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 CYTH4-202ENST00000402997 633 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 PDCD4-AS1-201ENST00000420367 778 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 APOBEC3H-203ENST00000421988 592 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AL049542.1-201ENST00000430231 278 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 LINC00879-202ENST00000463200 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AP001453.2-201ENST00000544553 391 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC022296.3-201ENST00000608823 403 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AL627230.7-201ENST00000613971 601 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 VRK3-202ENST00000377011 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC067852.6-201ENST00000591237 1736 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 SEPT4-203ENST00000393086 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 PPP4R1L-201ENST00000244070 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 TARS2-214ENST00000606933 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 LINC02140-202ENST00000566649 2017 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 IGF2BP1-202ENST00000431824 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AL157414.1-201ENST00000366097 770 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC019349.1-201ENST00000411759 476 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 SWI5-204ENST00000419867 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AL132709.1-202ENST00000448840 588 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 RN7SL756P-201ENST00000488739 268 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 OR7E26P-201ENST00000502808 1006 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC091893.1-201ENST00000503772 399 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 MIOXP1-201ENST00000521205 835 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
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