Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SOCS2-AS1-201ENST00000499137 3325 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 HDGF-203ENST00000368209 2171 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ITPRIP-202ENST00000337478 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 RCBTB2-206ENST00000544904 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 STIM1-209ENST00000527651 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ITGAL-203ENST00000433423 1416 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC021517.1-202ENST00000585897 2111 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 STPG4-201ENST00000294947 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 RNF113A-201ENST00000371442 1353 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 POFUT2-213ENST00000612472 2959 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 WT1-AS-201ENST00000395900 3828 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 TMUB2-203ENST00000446571 1580 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 NLRP2-214ENST00000543010 3576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 HSPA4-204ENST00000615899 2204 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 RAD1-203ENST00000382038 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 OAS1-208ENST00000551241 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 LINC01471-201ENST00000461398 3079 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 RETREG3-201ENST00000309428 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 BCORL1-205ENST00000540052 7127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms