Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 HACD3-201ENST00000261875 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NICN1Q9BSH3 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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