Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 AP000229.1-201ENST00000608591 1979 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC27P30260 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 BEST1-208ENST00000534553 1829 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC27P30260 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC27P30260 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC27P30260 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC27P30260 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC27P30260 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC27P30260 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC27P30260 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDC27P30260 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AFG3L2P1-201ENST00000521792 1763 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDC27P30260 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms