Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
HOXA3O43365 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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