Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC12Q8WUD4 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms