Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC024028.1-201ENST00000437145 437 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 TPI1P3-201ENST00000335020 740 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CGNL1Q0VF96 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 295.6 ms