Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CLK1P49759 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 UBA52-202ENST00000442744 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 ZNF200-205ENST00000431561 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 ARMCX2-202ENST00000330154 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CLK1P49759 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 COL4A6-209ENST00000545689 6380 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 KDM5B-203ENST00000367265 10345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 NLRP7-201ENST00000328092 3299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 ARHGAP24-203ENST00000395184 4661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 B3GAT2-202ENST00000615536 5206 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CLK1P49759 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms