Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SCN2BO60939 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SCN2BO60939 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SCN2BO60939 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SCN2BO60939 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SCN2BO60939 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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SCN2BO60939 CC2D1A-208ENST00000589606 3117 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SCN2BO60939 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SCN2BO60939 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SCN2BO60939 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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SCN2BO60939 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SCN2BO60939 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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