Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC12Q8WUD4 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms