Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
GCAP28676 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 SUCLG2-201ENST00000307227 2352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 LINC01134-203ENST00000442673 3059 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 CEACAM20-206ENST00000621342 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 UBE2A-210ENST00000630695 1771 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 HERC2P3-208ENST00000430598 4279 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC008676.1-201ENST00000508443 1932 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
GCAP28676 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 GRIK1-203ENST00000389125 3140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 PPP4R3A-206ENST00000554943 3369 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 SLC44A4-202ENST00000229729 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC011511.5-201ENST00000589379 3219 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 PRDM11-204ENST00000530656 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 MRO-203ENST00000428869 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 RNF219-AS1-209ENST00000606429 2418 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
GCAP28676 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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