Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMTNP53814 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMTNP53814 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMTNP53814 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMTNP53814 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMTNP53814 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMTNP53814 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMTNP53814 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMTNP53814 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMTNP53814 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms