Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 TRAF6-202ENST00000526995 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AL591926.3-201ENST00000611630 238 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 ITGB1BP1-201ENST00000238091 1772 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 KCNJ11-201ENST00000339994 2801 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 TNRC6B-203ENST00000402203 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 H3F3B-201ENST00000254810 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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