Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC138150.2-201ENST00000589796 2053 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
VPREB1P12018 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 SLC25A25-AS1-201ENST00000418747 6391 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 SATB2-AS1-205ENST00000450728 3314 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 OTOA-203ENST00000388957 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 OSBPL3-204ENST00000409069 2614 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 UGT1A10-201ENST00000344644 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 CSPG4P12-201ENST00000558282 4853 ntBASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC8.79□□□□□ -1
VPREB1P12018 AMMECR1-IT1-201ENST00000418848 561 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms